8月24日，据国内媒体体育商业大新闻报道，新疆男篮曾在6月25日按照CBA规则向周琦发出了固定工资续约合同，但周琦本人直到现在也没有续约。到目前为止，没有其他球队向新疆报道周琦的交易。

新疆队提供了顶薪合同，周琦还没有签约

周琦的球队在6月份向CBA联赛纪律和争议解决委员会提交了仲裁，因为周其芳认为新疆男篮违反了合同，没有履行合同。周琦今年夏天成为自由球员。根据CBA规定，新疆男篮拥有周琦的独家签约权，即如果新疆提供顶薪，周琦必须接受。经过仲裁，周琦团队的五份申请全部被驳回，周琦团队败诉。

周琦没有签新疆男篮新合同，是因为周琦拒绝签新合同，导致新疆男篮新赛季球员无法注册。新疆男篮无法为周琦注册，如果在8月31日之前没有达成合同，周琦很可能会导致下赛季无球可打的局面。知名体育博主半神卡特表示：既然周琦是中国男篮的核心球员，中国篮协也不希望他最终无球可打，浪费一个赛季。毕竟如果周琦无球可打，可能会影响国家队备战亚运会、亚洲杯等重大赛事的表现。因此，中国篮协伦理纪律委员会正在用尽一切办法在规则范围内调解此事，试图在报名截止前找到解决办法，让各方最终都能得到满意的答复。

2020-2021赛季，周琦在CBA常规赛出场33分钟，得到20.8分11.9篮板2.7助攻1.1抢断2.2盖帽，带领新疆以常规赛第四名的身份进入季后赛。